O Instituto Florestal administra 10 Estações Ecológicas, 1 Parque Estadual, 18 Estações Experimentais, 2 Viveiros Florestais, 2 Hortos Florestais e 14 Florestas Estaduais (mais de 53 mil ha), além de apoiar a gestão da Reserva da Biosfera do Cinturão Verde da Cidade de São Paulo (Programa MaB-UNESCO).

Estão disponíveis, para download, o Mapa das Áreas Protegidas do Instituto Florestal e a Lista das Áreas Protegidas do IF.